浸水營古道於1885年開通後，即設置溪底營，為清領時期通行古道的官吏商旅選擇歇宿的地點。日治時期，臺灣總督府於1916年在此處設置姑仔崙駐在所，數年後又將駐在所遷往稜線上方，到了1960年代後期，國民政府則在溪底營設立造林苗圃。

位於大漢山東南稜的出水坡駐在所，佔地寬廣，設置於1919年，海拔約700公尺，為日治末期浸水營古道東段唯一的駐在所。清領時期，開始設有出水坡營，屯兵30人劃分3隊，到了日治時期，臺灣總督府就在營盤舊址上建造駐在所，數年後再次遷移至不遠處重建。事實上，出水坡駐在所持續使用到二戰日本投降後才撤除，但從1960年代開始，林業工人運用遺址作為工寮。時至今日，不難在遺址上發現生活遺物。

位於大漢山東南稜的古里巴保諾駐在所，設置於1917年，海拔約750公尺，為浸水營古道通往南方聯絡道路的重要警備點，距離出水坡駐在所約1.3公里。由於1914年浸水營古道發生南蕃事件，致使道路中斷數年，臺灣總督府因而派員調查蕃情，復舊橫斷道路，同時增設了大樹林駐在所和古里巴保諾駐在所。其後，1926年古里巴保諾駐在所撤廢，重新於南方支稜下的茶茶牙頓社一帶新設駐在所。

浸水營的地名由來，原為清領時期創設的大樹林營，後於1894年改稱浸水營，最早見於鳳山縣廩生盧德嘉在同年編纂完成的《鳳山縣采訪冊》中。根據臺灣古道研究專家楊南郡指出，由於此處終年雲霧深鎖，雨量豐沛，加上地勢平緩容易積水，遂名為浸水營。日治時期，臺灣總督府於1901年新設浸水營駐在所，海拔約1280公尺，是往來東、西部官吏商旅的重要中途據點，但1914年發生浸水營事件，駐在所受排灣族人焚毀，其後歷經重建、改建，仍於1936年撤廢。

位於浸水營國家步道指示標誌2.6公里處的州廳界，為日治時期高雄州和臺東廳的行政分界，同時也是地形坡度的升降分野，從大漢林道登山口前往州廳界的通道是上坡路段，越過州廳界後則是一路下坡。根據林務局設立的州廳界解說牌記載，日治時期臺灣總督自臺東廳啟程巡視浸水營古道時，高雄州知事與各級官員都會在此迎接，並且，由於此處終年雲霧深鎖，年雨量豐沛，加上地勢平緩容易積水，遂名為浸水營。

位於屏東縣枋寮鄉新開村的崁頭營遺址，為日治時期浸水營古道之起點，始於1907年3月29日闢建。時至今日，遺址內尚存一幢清領時期的石造營舍，目前作為倉庫使用，但從砌石的地基仍可看出部分原貌。日治時期，崁頭營遺址主要作為崁頭警官駐在所，出入需申請「入蕃許可」，經查驗後才可通行，現因私人租用之故，林務局所規劃的浸水營國家步道改由新開苗圃旁進入，並設有解說牌，步道可通往歸化門。